亡き姉の未練を晴らすまで、常盤台中学への復讐に燃える沙淡扇は止まらない。このまま計画が進めば、無辜の数万人が犠牲になってしまう。潔斎雪紫は意を決して、沙の説得を試みる。一方、雪紫の姿が見えないことに気づいた御坂美琴は学友たちの協力を得て寮を抜け出し、彼女を探しに向かうが……。