流星の死とともに、ひとつの物語が幕を閉じた―― しかし、それは「始まり」に過ぎなかった。 数ヶ月が経ち… 悪性物による感染が静かに進行するこの世界で、久慈良平はかけがえのない“声”を継承した。 精神を侵し、身体を蝕む“悪性の種”。それに抗える者――“穢れ喰い（けがれぐい）”たちの運命が、再び交錯し始める。 誠の過去に秘められた“救えなかった少年”。 エルミナが背負う“焼かれた家族の記憶”。 それぞれの痛みが、今なお彼らを突き動かしている。 そして舞台は、新たな局面へ。 病院で密かに広がる感染。 無数の“完成体”が生まれようとする中、良平の前に現れる謎の政治家・石場流。 その裏には、生物兵器を利用し「世界の均衡」を壊そうとするエドワードの計画が動いていた。 かつての仲間・流星の力を受け継ぎながらも、未熟なまま戦場に立ち続ける良平。 彼に迫るのは、新たな“感染者”たち―― そして、最も危うい存在となりつつあるミオの運命。 誰を信じ、何を選び、何を守るのか。 魂を削って戦う穢れ喰いたちの第二章――ここに開幕。