憧憬著神之塔塔頂的少女蕾哈爾在某天獨自離開前往神之塔，少年為了尋找她也隨之步入了神之塔。歷經艱險卻突然被蕾哈爾背叛，少年因此差點丟掉性命。蕾哈爾成為神之塔最大犯罪集團FUG的一員之後，少年為了弄清楚自己被蕾哈爾背叛的原因，決心再次登塔……