ダンジョンが存在する現代の地球。 初めてダンジョンに挑んだ高橋直人が得たのは、誰もが「変態」と笑う謎のスキルだった。 しかしその正体は、自分や他人の身体を作り替える《人体改造》。 直人は無傷の腕を機械へと改造し、やがて片腕を失った冒険者に新たな腕を与える。 改造を受けた者たちが再び戦場へ戻る中、直人のもとには次々と依頼が舞い込んでくる。 これは、ひとりの人体改造師が、仲間たちと秘密のダンジョンギルドを築いていく物語。