西暦2750年、地球連邦政府の防衛委員会は総司令部第5司令部(特殊作戦司令部)第5課に対アレイラ特殊任務部隊(SCA)を設立した。通称セントクリムゾンエンジェルと呼ばれる、史上最強チームの発足であった。 『ファウラの死神』と渾名(あだな)されるスカーレットは、ここ数年現場を離れ後輩指導にあたっていたが、この新チームのメンバーとして現場に呼び戻された。 果たして、スカーレットに課せられた新たな任務とは？