かつて異世界を救った魔法使いサーラゼルの転生者・小桜は、現代の日本に伝わる三種の神器にも、魔導AIと関わる異質な力が宿っていることを知る。 その一つ、草薙剣を追う小桜は、仲間たちとともに熱田神宮が主催する体験入学へ潜入する。そこでは、普通の学校生活の裏側で魔導AIを巡る思惑が交錯し、思いもよらない形で神器の秘密へと近づいていく。 一方、秘密結社オラクルコードと犯罪組織ノクターナルも、それぞれの目的を胸に三種の神器を追い続けていた。 やがて小桜たちは、東京駅の地下に残された奇妙な痕跡と、「東京駅と皇居が地下で繋がっている」という都市伝説に行き着く。 魔導AIの力を使って地下を探索する小桜たち。 皇居周辺に隠された謎を追うオラクルコード。 そして、独自の方法で地下への入口を探すノクターナル。 三つの勢力が、それぞれ異なる入口から地下へ向かったとき、長い間閉ざされていた迷宮が、その姿を現し始める。 三種の神器を巡る戦いの先に待っているものは何なのか。 そして、東京の地下深くには何が眠っているのか──。