桜咲く暖かな季節。高校入学を控えた少女、泉布由（いずみふゆ）が匹の黒猫を追いかけてたどり着いたその場所は、森の奥にひっそりと佇む「喫茶クロネコ」。そこは「普通の人間は来られない」とても不思議な喫茶店だった。 その喫茶店で布由は店主だという同い年の少女キリカと出会う。彼女の正体は、なんと本物の「魔女」だった。 人間と魔女、出会うはずのなかった二人の少女が紡ぐ人と魔女の温かくも少し不思議な物語が、今始まる。