主人公・本条圭介は、東京の大学に通う、普通の理系の大学生。学年的には４年生であるが、卒業を前に留年したため、一年間自由な時間ができた。せっかくだから好きなことをしようと、家で専門である計算機代数学を勉強する時間が増えた圭介。そんなとき、女子高生の妹がグレブナー基底に興味を持ち始めて…？そして、主人公、妹、グレブナー基底をめぐる三角関係の行方は！？