主人公・青葉蘭は、武装偵察及び戦闘高等学院に通っている。この学院は、表向きには世界中で次第に台頭してきたテロ犯罪を防ぐために設立された、世界的な学院とされている。 彼の所属する部門は強襲科。その主な役割は、正面戦闘、奇襲、さらには強攻だ。 やや古臭い話ではあるが、現代においてなお刀剣を主武器として使うなど、あまりに時代遅れにも思える。だが学院は、生徒が刀剣を使うことに対してかなり寛容だった。刀剣には人の潜在能力を引き出す超自然的な力が宿っており、人に唯一無二の超能力を与えるからだ。 任務を重ねるうちに、彼は学院の役割がテロ組織犯罪の解決だけではないらしいと気づいていく。世界の真実、人類の真実とは何なのか。そして学院と政府はいったい何を隠しているのか。