時は20世紀初頭、舞台はパリ――。巷では、華麗な盗みを繰り返す「怪盗クラウン」が話題となっていた。その正体は、サーカス団に属する少年少女。そんなある日、怪盗団のリーダー格・少年ラウールは、言葉巧みな「仮面の男」に首飾りを盗むよう依頼される。ターゲットの所有者のもとには盗みの予告状が届き、警固体制は万全に。怪盗クラウンはどのようにミッションを成功させるのか？一方で、仮面の男が依頼した品には世界をも覆す驚くべき秘密が!?突如として大きな陰謀に巻き込まれたラウールたちの運命やいかに……!?