人類が宇宙に進出し数世紀。 西暦は新星歴に変化し、異星人との交流も行われ 銀河人類同盟が形成されていた。 人類は同盟内での小競り合いの他にも、異次元宇宙から来た侵略者 機械生命体デブリスにも悩まされていた。 デブリスや他の勢力に対抗する為、人類は人型巨大ロボット兵器 ギャラクシー・アサルト・トルーパーことGATを開発。 人類宇宙圏内の軍事主力兵器となっていた。 そんな世界の辺境惑星サードジャパンにある銀河人類同盟軍士官学校 サードジャパン校では、騎兵科の学生達によるロボットバトル大会が 催されていた。 主人公の少年、ハルト・イクサバは決勝戦で幼馴染みであり ライバルであるエミリー・A・レッドスターとの対決に挑むのであった。