地球を侵略する「Ｕインベーダー」が世界から明かりを奪い去った一年後。世界連盟政府は密かに対抗する手段を開発した――ウイルスを滅ぼすための、最強の抗体を作ること。「優秀」な人間として政府の募集に応じたマコト・スターリングは、意識が電脳世界に飛ばされる。目が覚めると、目の前にいるのは抗体と自称する少女アルファとＵインベーダーだけが現れた。マコトは混乱するが、アルファは「最強」にならねばならないと彼に告げる。そのために必要なのは……口付けである。