十五歳で理不尽に暗殺された少年は、影のない白い虚空で目を覚ました。 翼を持つ女神から突きつけられたのは、「自分を肉弾戦で倒せば、恐るべき力と共に第二の人生を与える」という神の試練。 だが、少年が女神を超えるために費やした時間は、想像を絶する『百万年』だった。 終わりのない処刑と復活のループの中で、少年の人間性は消滅し、純粋な戦闘本能を持つ「亡霊（怪物）」へと変貌を遂げた。 百万年の果てに神を凌駕し、異世界へと降臨した彼の身体には、次元を超えた絶対防衛圏『イージス・マトリクス（Aegis Matrix）』から無限のエネルギーを汲み上げるピッチブラックの心臓と、五つの脳が宿っていた。 宇宙を消滅させるほどの破壊力を手に入れた彼は、しかし世界の破壊ではなく、ただ「普通の生活」と「大切な家族」を守ることを選ぶ。 かつて虚空の亡霊と呼ばれた最強の男の、小さな平穏をかけた戦いが今始まる。