ノエル・クロフォードはかつて、天才ボーイソプラノと呼ばれていた。だがその美声は変声期と共に失われ、十六歳の今はソプラノでもテノールでもない中途半端な声を持て余している。
　伸び悩む彼はついに、歌の師匠に破門されてしまった。

　行き場を失った彼が見つけた就職先は、幼なじみの誘いで加わった聖騎士見習い。だが、聖騎士隊長はノエルに極秘任務につくよう命じた。
「女装して聖女学園に潜入せよ」と。

　聖女学園では、少女たちが次々と眠りに落ち、二度と目覚めない怪事件が起きていた。

　抵抗の末、プリーツスカートを履いたノエルを待っていたのは、初恋の少女リタとの相部屋生活だった。

　少女に扮して学園生活を始めたノエルは、寮母が鏡に映らないという奇妙な事実に気が付く。

　学園において、聖女候補の少女たちは音楽を捧げて聖獣を呼ぶ。
　ろくに楽器演奏ができないノエルは、聖獣を召喚できないと思われたが――
　
　ノエルの楽器は、自分でも認めたくなかった中性的な歌声だった。
　その声に呼ばれてやってきたのは、清らかな乙女にしか懐かないはずのユニコーン。
　
　聖獣のくせに言動が変態なユニコーンを相棒に、ノエルは学園にはびこる闇に立ち向かう。
　男らしくなりたいともがきながら、逆方向へ疾走しているノエルは、少女たちを眠らせている敵の正体を暴けるのか――？