東京・新宿。 ネオンが輝き、数百万人が行き交う眠らない街。 その地下には、人間の誰も知らないもう一つの世界があった。 主人公は一匹の若い父ねずみ リク。 妻の ハル。 そして生まれたばかりの四匹の子ども。 家族で幸せに暮らしていたある日、 ビルの解体工事が始まり、巣は一瞬で崩壊する。 住む場所を失った家族。 逃げる先々には、 巨大な猫。 群れを作るカラス。 毒エサ。 ネズミ捕り。 車。 下水の洪水。 そして―― 同じ食料を奪い合う他のネズミたち。 東京は優しくない。 パンくず一つを見つけるため命を懸ける。 コンビニの裏。 飲食店街。 駅のホーム。 地下鉄。 公園。 それぞれに縄張りがあり、 食料を巡る戦争が起きていた。 リクは何度も命を落としかける。 仲間を失う。 子どもが病気になる。 冬には食べ物がなくなる。 それでも、 「生きろ。」 父として、 家族を守るため、 東京という巨大な森を走り続ける。 ⸻ しかし最後に待っていた敵は、 猫でも、 人間でもない。 東京都全域で始まる 大規模害獣駆除作戦。 街中に毒がまかれ、 罠が仕掛けられ、 地下道まで封鎖される。 東京中のねずみ達が 絶滅の危機に追い込まれる。 果たしてリクは家族を守れるのか。