アリスはもう子供ではない。 今は若い女性として、驚きを忘れてしまったかのような世界で自分の居場所を探している。しかし、責任と成長した女性の背後には、あの好奇心旺盛な少女が今も生き続け、ありえないことを信じる力を持っている。 だからこそ、彼女だけがそれらを見ることができるのかもしれない。 人混みを気づかれずに駆け抜けるウサギたち。トランプの姿をした兵士たちが人々に紛れ込んでいる。屋根の上から見下ろす、ありえない生き物たち。 侵略が始まった。 ハートの女王はワンダーランドの境界を越える方法を見つけ、アリスの世界を征服しようとしている。最も恐ろしいのは、人間には侵略者が見えないということだ。 アリスだけがそれを見ることができる。 女王の軍隊に追われ、彼女の中に特別な何かを見出したらしい不思議な仲間たちに導かれ、アリスは侵略を阻止できる3つのアイテムを探し求めなければならない。それは、古代の鎧、ワンダーランドの生き物を傷つけることができる剣、そして誰もその真の力を明かそうとしない謎の指輪だ。 しかし、今回は彼女は絵本の中の世界にいるのではない。 傷は現実だ。 そして死もまた現実だ。 アリスは共に戦った仲間たちが倒れていくのを見届け、もはやただ生き延びるだけでは済まないことを悟る。世界を救うためには、ワンダーランドを最後にもう一度横断し、すべての元凶である女と対峙しなければならない。 ハートの女王。 そして今度こそ、アリスは彼女から逃げない。 彼女は女王を殺すだろう。 誰も目にすることのなかったあの戦争から長い年月が経ち、アリスは羽根ペンを手に取り、一冊の本を書き始める。 もし世界があの夜に命を落とした人々を記憶にとどめないのなら、アリスは自分の「不思議」を永遠に語り継ぐことを誓う。