宮廷錬金術師のアルトは、役立たずと罵られ国外追放されてしまう。しかし彼の能力は、魔力の宿らないゴミ素材から規格外の霊薬や神話級ゴーレムを創り出す唯一無二の万能錬金術だった。追放先となった未開の荒野で、アルトは倒れていた獣人少女フィリアを助け、自作アイテムで快適な拠点を開拓していく。一方、アルトを失った帝国は資材不足で大混乱に陥っていた。万能ポーションや農具で領地を大発展させるアルトの元には、腕利き冒険者や商人が集結。やがて荒野は世界一豊かな都市へと変貌し、アルトは新たな国の主として認められていく。