錬金術師の少女、セシリア・クラフトハイム。錬金術が大好きな彼女には、世界中を冒険してまだ見たことのない素材をこの手で集めて、自分だけのものを錬金術で作りたいという夢があった。 　珍しい薬草を求めて森へ。希少な鉱石を求めて鉱山へ。時には危険な魔物が待ち受ける未踏の地へ。 　戦うことが苦手なら、爆弾を作ればいい。 　毒があるなら、解毒薬を作ればいい。 　進めない場所があるなら、進むための道具を作ればいい。 　そうして錬金術とともに世界を巡り、未知の素材を集め、新しいアイテムを生み出していくセシリア。 　本人はただ、大好きな錬金術と冒険を楽しんでいるだけ。 　けれど彼女の作り出す品々は、やがて人々の常識さえ塗り替えていく。 　これは一人の少女が世界を巡り、やがて「神工の錬金術師」と呼ばれるまでの物語。