魔法少女が、魔法少女に殺された。 怪魔を倒し、人々を守る「平和の象徴」――魔法少女。 その一人、ベテラン魔法少女・輝夜坂きららが何者かに殺害された。 犯人は、同じ魔法少女。 新人魔法少女・東雲神楽は、先輩の神原イブキとともに「魔法少女狩り」の真相を追い始める。 なぜ魔法少女は、魔法少女を殺したのか。