大地震で妖の封印が解け、陰陽師達が活躍をする時代。主人公の鳴神牙とパートナーである十二天将の朱雀赤羽疾風が妖の通り道の妖黒門を封じたと思えたが、芦屋道満の策略により、牙と十二天将の呪力が奪われ始めた。すべては芦屋道満の 計画通りだった。身動きが取れないまま目の前で疾風が芦屋道満にさらわれてしまった。　後日 救出すべく牙達と十二天将が救出に向かうが、 牙達の前に現れた、牙の知る人物が立ちはだかりー！　雷の陰陽術を使う牙と炎の陰陽術を使う 十二天将赤羽疾風の二人が転生に関わる運命に立ち向かう！