東京湾岸、竹芝桟橋付近の岸壁で男性の溺死体が上がった。殺人の疑いがあり、所轄署に捜査本部が置かれる。指揮を執るのは警視庁捜査一課長・南雲和孝警部。事件を調べていくうちに、湾岸地域における再開発事業が関係していることが判明する。