古代エジプト最後の王朝―プトレマイオス朝クレオパトラ7世の治世、アレクサンドリアにフィロタスという若き医師がいた。しかし、アクティウムの海戦に王朝は大敗し、滅亡の一途を辿る。遂にローマ軍によりアレクサンドリアは陥落し、彼は捕虜となり奴隷の身分へ落とされてしまう。 　冷酷なローマ貴族の元、再び自由を手に入れるため、アレクサンドリアの「知」を注ぎ込む――。