魔力適性の低さを理由に一族から追放された少年、レイ。彼に遺されたのは、誰からも評価されなかった古代語と魔導回路の膨大な知識だけだった。あてもなく彷徨う最中、激しい雨から逃れるように足を踏み入れのは、地図にも載っていない古代の地下遺構。その最奥でレイが出会ったのは、数百年もの間眠り続けていた一体の機械少女——『ALT1』だった。 持ち前の知識で封印を解き、少女を目覚めさせたレイ。彼女を「アルティ」と名付けたことで、二人（一人と一機）のあてのない旅が始まる。 感情を持たないはずの機械少女。しかし、落ちこぼれの少年と世界を巡るうちに、彼女の胸のコアには存在しないはずの「エラー」——心が芽生え始めていた。