銀河の片隅にある惑星・アマノホシ。
そこには、身長わずか一寸――約3センチほどしかない少年、星野スイが暮らしていた。
小さな身体に生まれたスイは、幼い頃から「自分には何もできない」と言われ続けていた。
それでも彼には、ひとつだけ夢があった。
――いつか宇宙の中心にある巨大都市「星都エデン」へ行くこと。
ある日、スイは祖父から古びた一隻の宇宙船を譲り受ける。
その姿は、まるで巨大なお椀。
さらに武器として渡されたのは、一本の箸から作られた光剣だった。
「この船と剣は、お前の先祖が使っていたものだ」
そう告げられたスイは、お椀型宇宙船《ワンボウル》に乗り込み、星都エデンを目指して旅立つ。
しかし、その途中で銀河を支配する謎の軍団――鬼星帝国と遭遇する。
鬼星帝国は、惑星の生命エネルギーを奪い取る「星喰い装置」を使い、次々と星を支配していた。
そしてスイが持つ光剣には、鬼星帝国が長年探し続けていた伝説の力――**「一寸の星核」**が眠っていた。
小さな少年と、奇妙なお椀型宇宙船。
彼の武器は、たった一本の箸の光剣。
仲間も、力も、経験もない。
それでもスイは前へ進む。
「小さいからって、宇宙まで小さいわけじゃない！」
やがて彼は、宇宙を揺るがす巨大な戦いに巻き込まれていく。
これは、誰よりも小さな少年が、誰よりも広い宇宙を駆け抜ける――
銀河一寸の大冒険である。