小学六年生のマナヤは小学校最後の夏休みを迎えるが夏休みの初日クラスのさえないモブキャラの田中が行方不明になる！ マナヤは、親友のタイト、コースケ、サクネ、と共に少年探偵隊を名乗り田中探しへ駆り立てる 「俺たち少年探偵隊結成しようぜ!」 田中は一体どこへ消えたのか… 田中が残したメッセージとは… ー少年探偵隊の終わらない夏休みが始まるー