魔法少女。 あの事件以来、耳にする事がなくなった言葉。 人々を熱狂させ、時代を彩ったこの言葉も今や完全に過去の産物である。 人間が突然魔物化し、暴走する。 魔法少女時代から現在に至るまで解明されていない謎の現象。 時代の流れとともに、魔法少女に変わってどんどん大きくなっていった魔研機関。 昔は魔法少女のサポート、魔物の研究にすぎなかったこの機関が現在は魔物の討伐から研究まで全てを担う一大組織となっている。 あの事件のせいで"魔法少女"という存在を完全にこの世からなくすため、憎い魔物をこの世から根絶するために魔研機関で働く青年シオウの物語。