昔、神風を受けた少年がいた。彼はもういない。一羽の烏に導かれ、儚く逝ったのだ。 中央政府が瓦解し、独立した各都道府県が制空権を争う「工業列強」の時代。旧首都・東京を覆う絶対不可侵の防衛網を前に、幾重もの攻略戦は潰え、空は無数の兵士たちの墓場と化していた。 追い詰められた軍が死地に送り出したのは、一人の少年・篠崎洋介。 彼が駆るのは、病ゆえに捨てられた人々が集う「烏里」の技術者たちが、日本の未来を託して遺した唯一無二の鋼鳥——「八咫烏」。胸に埋め込まれた不気味な装置「勾玉」を通じ、洋介は自らの肉体と精神を機体へと接続する。 生きては戻れぬ無茶振りの任務。涙で滲む紙に遺書を残し、洋介は命を叩きつけるように夜空へ躍り出る。 だが、死を覚悟した少年の涙と生への執着を刻み込んだ「八咫烏」は、彼をただ死なせるための兵器ではなかった。失われた「日本」の姿を取り戻すため、そして絶望の空を希望へと変えるため、一羽の烏と一人の少年の、果てなき決死の飛翔が始まる。