平凡な会社員・黒崎蓮は、深夜の会社で謎のパソコン画面に遭遇する。 そこには突然、「異世界へ転生しますか？」という表示が現れ、拒否しようとするも選択肢を奪われ、異世界への転生を強制されてしまう。 転生特典として蓮が選んだのは「万能魔力」。 その直後、謎の表示――《始原》が現れる。 異世界で目を覚ました蓮は、自分が見知らぬ少年の姿になっていることに気づく。さらに、突然現れた巨大な黒竜に追われることに。 しかし黒竜は人間の少女へと姿を変える。 少女の名は――クロエ。 クロエは蓮のことを知っており、彼を守るために現れたという。 なぜ自分を知っているのか。 なぜ守ってくれるのか。 その理由をクロエは「今はまだ話せない」と告げる。 こうして、謎を抱えた黒竜の少女クロエとともに、蓮の異世界での新たな人生が始まる――。