人々の感情や信仰、欲望から、現代にも新たな神が生まれている。 幼い頃、邪神によって両親を殺され、妹を攫われた少年・刀弥。 青年となった彼は、神格事件に対処する公的機関【神格鑑定局】に所属し、神殺し専門の『特別鑑定士・コードネーム神斬（カミギリ）』として戦っていた。 神斬が力を借りるのは、契約を交わした七柱のカミサマ。 片目や片腕、寿命、感覚、死後の魂――その身を代償として削りながら、相棒の少女・リエルとともに危険な神格を撃滅していく。 すべては、攫われた妹を救い出すため。 そして、家族を奪った七柱の邪神を斬るために。