帝都から東北の田舎町・神境町へ転校してきた少女、芝村希望。 幼い頃から人ならざるものを感じていた彼女は、一年前の事故を境に妖をはっきりと視るようになっていた。 転校初日、希望は行方不明になった弓道部員の存在を知り、陰陽寮から派遣されたという教師・草壁歳也と出会う。 そして夕暮れになるたび、黒い烏を連れた謎の少年が彼女の前に現れる。 「逢魔が時には、気をつけて」 人と妖の境が揺らぐ黄昏から、一人の少女と陰陽師の物語が始まる。