二つの惑星が衝突した光が地球を撫でた日、中学二年生・佐倉湊（さくら みなと）は白亜紀の大地に一人立っていた。魔法も武器もない。あるのは十四年分の授業と、拾った石ころだけ。彼は生き延び、言葉を作り、書物を遺し、一万年早い文明を築いていく。