【誰もが怪獣を倒そうとする世界で、あいつだけが怪獣を直そうとした――】 突如現れる巨大怪獣と、それを討伐する『魔法少女』が国民的英雄として君臨する現代。 だが、その華やかな舞台裏には、冷酷な世界の真実が隠されていた。 ――怪獣の正体は、変身器（アストラル・ギア）の過負荷によって精神を汚染され、異形へと変貌した魔法少女たちの成れの果てだったのだ。 公式の魔法少女管理機構『AMDA』と巨大兵器企業『オラクル社』は、彼女たちを使い潰し、怪獣化させては『討伐』することで莫大な魔導エネルギーを回収・独占していた。 下町の片隅で寂れた修理店『白石怪獣整備所』を営む少年・白石湊（しらいし・みなと）。 見習い魔導整備士である彼は、傷つき廃棄処分寸前だった元トップアイドル魔法少女・星宮結衣と出会う。 「壊れた変身器は、倒すんじゃない。直すんだ」 湊は祖父から受け継いだ万能ドライバー【Ω-00】を手に、生身で暴走怪獣の体内へと飛び込む。 命を削る公式変身器を物理的・魔導的に解体し、少女たちの『原初の願い』を宿した唯一無二のカスタム変身器へと再構築していく。 救われた少女たち―― 絶対の相棒となる星宮結衣、 機構の不正を告発する元情報部参謀・如月志保、 音速の機動力を誇る天音ルカ、 元処刑人にして不器用な護衛剣士・黒羽冴香、 そして感情を奪われていた人工魔法少女・シエル。 国家反逆のテロリストとして世界中から指名手配されながらも、湊と少女たちは逃亡の軽バンを走らせ、世界の嘘を直すための反撃を開始する！ 「さあ、飯を食ったら仕事だ。世界中の壊された魔法少女を、全員直して救い出すぞ！」 見習い整備士の泥臭い職人魂と、救われた最強ヒロインたちの絆が紡ぐ、極上のヒロイン救済＆魔導工学バトルファンタジー！