東京・新宿西口で突如発生した大規模銃撃テロ。犯人が手にしていたのは、日本ではあり得ないはずの重火器「ミニガン」だった。 現場へ急行した警視庁第七機動捜査隊――博麗霊夢、霧雨魔理沙、十六夜咲夜、魂魄妖夢の四人は、命懸けの突入作戦で犯人を制圧する。しかし押収したデータの中から現れたのは、「人類はAIに負ける教」という謎のカルト組織の名だった。 彼らの掲げる思想は、“AIによる人類の支配こそ救済”。 やがて仲間である咲夜が誘拐され、四人は湾岸倉庫での救出作戦へ。さらに捜査を進めると、警察署長の汚職、巨大な地面師詐欺、地下兵器工場、そして日本政府中枢にまで及ぶテロ組織との繋がりが浮かび上がる。 味方だと思っていた組織は腐敗し、信じられるのは背中を預けられる仲間だけ。 東京を舞台に繰り広げられる、警察・SAT・特殊部隊・検察が挑む超大型クライムアクション。人類の未来を懸けた戦いが、今始まる。