『ドラゴニア』──無数のドラゴンによって空が覆われ、大地を蹂躙された世界。
　高校生の神代大和は、不慮の事故をきっかけにどういうわけか『ドラゴニア』の世界で目覚めてしまう。
　森の中を彷徨っていた大和は、そこで魔法使いの少女カエデと出会い、そして自らの体をドラゴンに変化させる不思議な力に目覚める。
　大和とカエデは森のなかで遭遇した火炎を操るドラゴンを二人の力を合わせることで撃破し、二人でドラゴンの謎を探る旅に出たのだった。
　旅に出た二人。その旅路で新たに出会ったのは、ドラゴンの気配を察知する力を持つ幼い女の子ソラと、水属性の魔法を得意とするミステリアスな魔法使いルウナであった──