原爆が日本に投下されて１００年が経ったその日、宇宙の彼方から数々の星を破滅させた一本の巨木が新宿に落下して来た。その巨木は新宿駅を中心とした周囲１キロを壊滅させた。 　巨木は【宙の木】と名付けられた。 　死んだ木と思われていた木は、嵐に襲われ雷に打たれると、目覚めた。目覚めた【宙の木】は花を咲かせ、その花は人や動物を食し、自らの栄養とした。やがて実をつけ、中から種子生物を誕生させる。種子生物は次々と人を襲い、根をおろして【宙の木】を増殖させていく。 　そして、【宙の木】と人類の果てしない戦いが始まるのだ。