現代日本の裏側に繋がるゲート。その中から、《禍妖》と呼ばれる妖怪が日本各地に出没した。その事は世間に知られておらず、被害者は行方不明として扱われていた。 その《禍妖》を倒す《禍祓い部》というものがある学校にあり、何も知らず、部活を強要されていた主人公は、入部を選ぶ。待ち受けていたのは、個性豊かな能力者少女達で……！？