二〇世紀末の日米関係と安全保障政策の変化、テロ紛争の影響によりロシアから兵器輸入が行われた世界線の日本。 自衛隊はロシア製戦闘機をベースに新型国産戦闘機、F‐2〈あおわし〉を開発し、自国の空を守っていた。 そして西暦二〇二八年、日本近海に現れた謎の構造物とそこから現れた人々の正体を調査するべく、政府は自衛隊の派遣を決定する。