〈春から境目《さかいめ》学園の中学二年生になりませんか？〉 この手紙をきっかけに境目学園に転校した少年「稲穂」は、親元を離れてあけぼの寮で暮らしながら学校生活を送ることになった。 稲穂の住む９号室のルームメイトはいたずら好きの少年「樹」といつでも笑顔を絶やさない少年「しずか」。 二人の正体はなんと、忍者の末えいに天才魔法つかいだった！ そんな訳あり９号室の使命は学園長の持つ「特別な天秤」を悪いやつらから守ること。 全くかみ合わない稲穂、樹、しずかの三人は無事に任務を遂行できるのか！ 自らもヒミツを持つ稲穂は、この９号室でやっていけるのか⁉