20XX年。 「H.M.N.」という組織が「時空の裂け目」を世界中に開けてしまい、なんの力も持たない民間人が巻き込まれる事件が多発。 その時空の裂け目を封鎖するために生まれた部隊、「星叶部隊」。 そんな中、一人の平凡な少女「音崎レイナ」は新しい高校生活への想いを馳せるが、既に世界は滅びかけてしまっていた。 そんなことも知らない少女は街を彷徨っているうち、星叶部隊に所属することになり、一緒に時空の裂け目を封じ込めることになってしまったお話。