SF小説ばかり読んでいた女子高生・マキこと真木灯里が転生した先は、ネオンと配管でできた魔導都市だった。 　この街の魔法の正体は、空気に混ざったナノマシン。誰もそれを知らず、祈り踊って生きている。ただひとり、命令できる私を除いて。 　周囲の物質を分解して武器でもガジェットでも組み上げるチートスキル〈ナノクラフト〉。ただし作れるのは、私が原理を理解しているものだけ。前世で読み倒したSFが、そのまま弾薬になる。 　そんな私が路地で拾ったのは、謎のお嬢様風の少女エルシャだった。世間知らずで、口が減らなくて、カップ麺の茹で方も知らない。 　追手はすぐそこ。逃亡者ふたりの、ろくでもない同居生活がはじまる。