戦争によって生み出された機械生命体が宇宙各地で生きる時代。メタルハンターを育成する銀河メタルハンター学院で、実技最下位のカイは、機械生命体の生態に詳しい少女ミナ、力自慢のガルド、発明好きのニコとともに、落ちこぼれだけを集めた特別補習クラスへ入れられる。