モンスターの血を持つ人間・Frisk。ある日Friskは人間からの迫害を逃れるため、モンスターが追いやられたと聞いた地下世界へと足を踏み入れる。しかし、そこにモンスターはおらず、かわりに自分とそっくりな少年・Ashがいた。彼は、この世界のモンスターがとある理由で滅んでしまったこと、Friskのソウルを使えばモンスターたちを元に戻せることを告げる。ソウルを差し出すことを躊躇うFriskにAshは…？