名家の令嬢、六条御夜子（ろくじょうみやこ）はある日突然謎の黒猫、ムラサキから魔法少女になってほしい、と勧誘を受ける。曰く、「シャイニーオリジン」なる集団が、ムラサキたちの世界を襲ったのち、次は御夜子たちの世界に侵攻する、と宣言したらしい。話を聞いて魔法少女になる事を承諾した御夜子。かくして、御夜子は同性の恋人兼、学校の先輩兼、同じくムラサキと契約した魔法少女の、三宮麗鋳菜（さんのみやれいな）や、ムラサキと協力して、シャイニーオリジン撃退に向け、戦いの日々に身を投じていくこととなる。