十年前、世界各地の有力な英雄たちが一斉に姿を消した「大消失事件」。 両親を亡くした主人公を育てた年の離れた兄も、この事件で行方不明となった。主人公は兄の足跡を追うため、世界中の英雄候補が集まる国際的なヒーロー大学へ入学する。 だが大学地下には、大消失事件の犯人とされたヴィランが極秘裏に封印されている。 主人公は彼と接触し、禁忌の「能力移植」を受ける。 主人公が得るのは、観察して構造を理解した能力を一時的に再現する力。ただし、同時に発現できる能力は二つまで。血統、契約存在、専用器官などは完全には再現できず、肉体への負担も大きい。 主人公は大学では英雄候補、地下ではヴィランの共犯者として、兄と大消失事件の真相を追う。