ある日突如として現れた怪しい雰囲気を纏った少女と少年時代を過ごすことになった里見慧悟（さとみけいご）は彼女が姿を消した時に遺した日記を大学三回の冬に翻訳する。それはとても少女が遺したとは思えないほど歴史的に価値があるものであった。卒論の内容に貧窮していた慧悟青年は、それらを纏めることを決意する。それはさておき、この世界には不思議な力がありふれていて、その力に恐れを抱く段階からそれらを利用する段階へと時代はパラダイムシフトしていた。この物語はその中で生き抜いた少女の物語である。