観測員ルカは廃鉱で、消えた姉の筆跡が勝手に浮かぶ手帳を拾う。「記録が現実を確定させる」異能を頼りに逃げ込んだ先で、情報の卵《ルクス種》を抱く少女ユラと出会う。名も足音も食われて薄れていく深部、追いすがる調査院。傲慢と呼ばれた力に揺らぐ彼は、赤い《辰砂導電糸》で感覚をつなぎ、彼女の孤独を味わう。「聞こえる？」「……痛いほど」。やがて二人は地底湖の影、《アエラムの樹》へ。記録と存在、そのどちらを救うのか——選択の夜が、音もなく迫る。