薬の製造を唯一の産業とする島｢久寿理島｣で、470年間、女子直系一族だった木葉家に突然生まれた男子･草太は、島の人から｢ぼっちゃんは天が下さったのです｣と言われて、大事に育てられてきた。15歳の春、草太は、その製法が女性のみに受け継がれてきた｢気やすめ丸｣を万人に効く薬へ改良するために、島の運命を背負って東京へと旅立つ。