地上を統括するAI「テラ」から、エイドリアン・フォスターたち4人に一つの任務が与えられた。 向かう先は、地下1000mに存在する巨大な施設。 そこには、長い間眠り続けているAI「ガイア」がいるという。 なぜ、自分たち4人が選ばれたのか。 なぜ、ガイアは地下深くで眠り続けているのか。 軍のサバイバル教育を共に生き抜いたエイド、ノア、グラント、リナは、理由も分からないまま地下へ向かう。 そこで彼らを待っていたのは、想像していた「調査」とは少し違うものだった――。