神から「紋章」を授かり、その力をAIが鑑定する世界。 7歳の少年・イグニスが受けた鑑定結果は「結論から言うね、この子の紋章はRレア」と、無情にも落ちこぼれの烙印を押された彼は、インフラすら整っていない最下層の掃き溜め『第二十三階層都市・アマノイワト』へと送られてしまう。 それから数年。暗い最下層で暮らしながらも、イグニスは幼い頃に読んだ「外の世界」への憧れを捨てきれずにいた。 そんなある日、彼の退屈な日常は唐突に打ち破られる。遥か上層から、謎の少女が幾重もの階層を物理的にブチ破りながら降ってきた。 天井を貫き、最下層へ落ちてきた少女との出会いが、イグニスの運命を大きく動かしていく。