ご当地自警団ヒーロー×男装ギフテッドヒロイン（フェルマーの最終定理） ギフテッドで、フェルマーの最終定理を解き明かした高校生、小城真珠(こじょう・まじゅ)は、前の高校で爆破予告の脅迫を受けた。理由は多分、天才だから。脅迫を理由に現在は男装して、性別を偽り秋ヶ瀬高校に通っている。 数学オリンピックに出場が決まった夏休み前のある日ーーまたも学校で刃傷沙汰が起きる。どうやら真珠は天才が故狙われているようだ。数学ができる女だから狙われたと思っていた真珠だが、今の自分は性別を偽っている。男のフリをしていても、やっかみや嫉妬で邪魔されているのだろうか。 そこに何故か自称、正義のヒーローであるむささび戦隊モモンガーと名乗る自警団的なコスプレ5人組に絡まれる。彼らの正体は同じクラスの滝瀬翡翠(たきせ・ひすい)とその兄弟だった。 モモンガーグリーンである翡翠は、真珠に対してお目付役であることを告げる。天才である真珠の行動によっては、命を狙うと言われる。モモンガーは敵にも味方にもなり得るらしい。 そして夏休みーー真珠は5人の従姉妹で、警察官である瑪瑙(めのう)の紹介で、翡翠らに夏休み中匿ってもらうことになる。 真珠は5人の店であるカフェ・ドルフィンを手伝いながら、新たな謎解きを行う。真珠を狙っていたのは天才集団・ジーニアスだった。ジーニアスのメンバーは、Gと書かれたカードを置いていく。ジーニアスの目的は、天才集団による国を作ろうという壮大なものだった。真珠はジーニアスではなく、モモンガーたちと地元で暮らすことを選ぶ。 真珠が解いた暗号は隕石落下の予定地だった。落下する場所に気づき、住民を退避させるモモンガーたち。 隕石落下の被害を最小限にした真珠は、モモンガーと共に感謝状をもらう。 男装をしている真珠だが、カフェでの打ち上げを経てナイトプールで翡翠に女だということがようやくバレる。だが、翡翠の兄である琥珀と水晶には会ったときからバレていた。翡翠の兄の御影や弟、鍾も真珠が女性だと気づかずに驚く。 真珠が女だと知らなかった翡翠だが、胸の鼓動が速くなるのを感じる。